Bilgisayar Mühendisliği Bölümü öğretim üyeleri ve öğrencileri, Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles (UCLA) ev sahipliğinde düzenlenen Hesaplamalı Genomik Yaz Enstitüsü 2025’e (CGSI) katılarak Bilkent Üniversitesi’ni temsil etti.
2016 yılından beri her yıl düzenlenen ve bir ay süren program, uluslararası öğretim üyelerini, doktora sonrası araştırmacıları ve öğrencileri bir araya getirerek iş birliğini teşvik etmeyi ve ileri düzey eğitim fırsatları yaratmayı amaçlıyor. Bilkent ekibinde öğretim üyeleri Dr. Can Alkan ve Dr. Ercüment Çiçek, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü’nden lisansüstü öğrencisi Ahmet Arda Ceylan ve Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Bölümü’nden lisans öğrencisi araştırmacı Zeynep Akçil yer aldı. Ekibe ayrıca Bilkent mezunu Gürkan Bebek (Bilgisayar Mühendisliği Lisans, 2001) de katıldı.
Etkinlikte Dr. Alkan, grubunun donanım/algoritma ortak tasarımı yoluyla okuma haritalamasını hızlandırma üzerine yaptığı çalışmalar hakkında genel bir sunum yaparken, Dr. Çiçek genomik veri paylaşımındaki gizlilik zorlukları üzerine bir eğitici sunum gerçekleştirdi. Öğrenci araştırmaları da öne çıktı: Dr. Çiçek ile birlikte çalışan Ahmet Arda Ceylan, antik DNA’daki kopya sayısı varyasyonunu karakterize eden bir algoritma olan LYCEUM’u sundu. Araştırmalarını Dr. Alkan ile yürüten Zeynep Akçil ise kısmi sıralı hizalamalar için Uygulamaya Özel Tümleşik Devre (ASIC) tasarımı üzerine olan çalışması POACHA’yı tanıttı.
